1985年,在总结50年代起开展的红壤研究经验基础上,中国科学院根据野外生态试验站(网)的布点需要选择在江西省余江县建立中国科学院红壤生态实验站,隶属于中国科学院南京土壤研究所。
1988年站鹰潭红壤站初步建成;1989年成为中国生态研究网络(CERN)的重点农业站;1990年被中国科学院批准为院属的野外重点站并对外开放,成为我国南方第一个开放实验站;1991年起承担国家区域农业科技攻关任务,成为南方红黄壤农业攻关试区站之一;2002年批准为江西省红壤生态重点实验室,是中国科学院与地方联合筹建的第一个联合开放实验站;2005年成为科技部国家农田生态系统野外科学观测研究站,为鹰潭站的发展提供了一个新的平台和层面;2007年成为第一批水利部水土保持科技示范园区;2011年批准为科技部国家红壤改良工程中心;2019年成为农业农村部国家农业环境观测站;2023年批准为发改委国家水土保持监测站。
经过近40年的不断发展,鹰潭红壤生态实验站已经成为中国科学院在我国红壤地区的农业、资源、生态与环境多学科综合研究基地,是集区域生态系统长期定位观测与研究、资源高效利用与农业可持续发展模式示范、优秀科研人才培养等功能为一体的大型野外开放研究实验站。